鉴于盛世才一意反苏，7月9日，苏联驻华大使潘友新见蒋介石，将7月3日莫洛托夫复盛世才函转交一份给蒋介石，其中一一列举盛世才欲出卖新疆、投靠苏联，反对国民政府、反对蒋介石等事实，并说苏联对其做法一直反对，“意在请委座制裁”（唐纵语）。因此前蒋、盛已沟通多次，关键是蒋介石此刻正要利用盛世才以使中央势力进入新疆，故对潘友新的“举报”反应平淡，言辞之间还潜含着对苏方的教训意味：“贵国政府对于凡关新疆之事应与敝国中央政府交涉，不可与盛督办迳行谈判。对于大使今日所述之事，俟余详阅此信后再行办理。”

表面上蒋介石轻描淡写，实际上却是异常重视，蒋命顾问事务处长卜道明迅将莫洛托夫函译出，交侍从室六组组长唐纵约“组中参谋秘书研究”，唐纵等研究后于11日提出如下意见：

关于盛苏关系与苏联用意的判断：

“一、苏联与盛世才关系决裂；二、苏联仍未放弃新疆之经营，且将有新发展；三、苏联通知我中央，希图取得我国之谅解，以阻遏盛世才与中央接近”。

关于我方之态度与对策：

“一、将苏方之表示告知盛世才，以坚定盛世才内向之心；二、通知苏方，新疆问题可与中央商讨解决，不得与地方折冲，以免造成国际之纠纷与误会；三、准备继任新疆之人选，俾问题发展到人事问题时，得以适应机宜为紧急处置。并加紧甘肃西部之防务，以为声援；四、随时准备通知美英，以加强问题之国际性。”

7月11日，朱绍良返渝，带回盛世才10日致蒋介石的复函，盛世才对莫洛托夫函的内容竭力辩解，说提出加入苏联成立苏维埃并非真意，而是为了“探测苏联政府对新疆是否有领土野心”，说苏联及中共在新疆工作人员均参与了暴动的策划，并表白其“竭诚拥护钧座与中央之赤诚，”说由于“地处边陲，民族复杂，情形特殊，”致主政期间多有失当，恳请蒋介石“曲予原宥”他。