1940年初，吴石与分别20余年的老友吴仲禧重逢。当时，吴仲禧在韶关任国民党第四战区长官部军务处处长和韶关警备司令。吴仲禧已于1937年卢沟桥事变前夕秘密加入中国共产党(新中国成立后任全国政协第五届委员、广东省司法厅厅长等职)。

具有爱国主义思想的吴石一方面想在抗日战争中扎扎实实地做一些事情，报效国家；另一方面，他又逐渐看透了国民党内部的腐败，并对蒋介石的内战政策感到厌恶。吴仲禧回忆说：“吴石对共产党人是有好感的。他读过毛泽东的《论持久战》等军事著作，在武汉珞珈山听过周恩来的演讲，还同叶剑英等人有过交往。”

冒险潜伏台湾

1942年1月，吴石任国民党军政部主任参谋兼部长办公室主任，1946年任国防部史政局局长。1948年春夏之间通过吴仲禧介绍参加“民联”，投身革命阵线，直接受何遂(新中国成立后任华东军政委员会司法部长)领导，单线联系。1948年，吴石任福州绥靖公署副主任，1949年元旦前后，吴石频繁地往来于福州、广州两地，多次潜往香港与李济深策划起义。1948年，中共中央社会部在福州设置工作站，并派遣谢筱迺到福州领导福州站情报工作。按党的指示，吴石向谢筱迺提供了不少重要军事情报，使得解放大军南下福建进军顺利。

1949年8月14日，吴石突接台湾来的急电，电文中，蒋介石命令其即日携眷赴台。迫于形势，吴石只能服从，作了与《潜伏》里余则成相同的选择。

吴石去台湾之前与吴仲禧见了最后一面。吴仲禧后来在回忆录中写道：“他告诉我，福建绥靖公署使命已经结束，他已被调任国民党国防部次长，要到台湾去任职。我曾请他考虑，到台湾去是否有把握，如果不去，也可以就此留下，转赴解放区。他坚决表示，自己的决心已经下得太晚了，为人民做的事太少了。现在既然还有机会，个人风险算不了什么。他接着说，为了避免嫌疑，他的夫人王碧奎和两个小儿女也要去台湾。留下大儿子韶成、大女儿兰成在大陆，虽已作了安排，还请我在必要时给予照顾……”