由此，吴国桢与蒋介石父子及台湾的挺蒋派展开了隔洋骂战。

在电视台谈话后不久，吴国桢在接受合众社记者采访时说：“我深信，目前的‘政府’过于专权。”十天后，在台湾“国大”二次会议召开之机，吴国桢又寄出《上国民大会书》，严厉批评台湾一党专权、特务横行和对民众进行思想控制。

台湾方面，当时的“立法院长”张道藩首先跳出来，列举了吴国桢自上海市长至台湾省主席期间的十大罪状，其中大都是类似“得款自肥”、“营私舞弊”等经济问题。与此同时，岛内许多忠于蒋家的要员们纷纷指责吴国桢“反动”、“狂妄”。

国民党的声讨自不待言，就连台湾大学与台湾师范大学的“全体教授”也披挂上阵，联名发表文章，攻击吴国桢。大学教授们认为，台湾言论自由，“都可畅所欲言”、有“集会结社自由”，吴国桢在台湾不讲话，在美国才讲话，品格有问题。

种种莫须有的罪名扣在了吴国桢头上，吴国桢忍无可忍，抛出自己的杀手锏，在美刊出《上总统书》，批评蒋介石“自私之心较爱国之心为重，且又故步自封，不予任何人以批评建议之机会”。同时，吴国桢还将攻击主要矛头直指“太子”蒋经国，说他是台湾政治进步的一大障碍。

为此，蒋介石恼羞成怒，于3月17日下令，以背叛国家、污蔑政府等十余项罪状撤免吴国桢“行政院”政务委员一职，并开除国民党党籍。至此，吴国桢与蒋介石彻底决裂。

此后，蒋介石向美国提出要将吴国桢引渡回台，遭到美国拒绝。美国远东事务助理国务卿罗伯逊通过美国驻台“大使”“劝告”蒋介石不要再对吴国桢施以攻击，否则将对台湾当局不利。蒋介石只好下令禁止台湾报刊继续刊登攻击吴国桢的文章。

至此，轰动台湾的“吴国桢事件”，以吴国桢长期流亡海外的结局而告终。但是，吴国桢还是对蒋介石曾经的器重身怀感恩，后来有人邀约吴国桢撰写回忆录时，尽管吴国桢已与蒋介石决裂，仍是婉言拒绝，并引古语以自喻：“‘负国之臣，不足以言忠也。’又何必自讨无趣耶！”