此刻，各路节度使都已经以为黄巢被高骈所灭，也以散去。听闻黄巢又死灰复燃，再来围剿已无可能，而且各藩镇之间也存在着极大的矛盾，所以都不愿再来和黄巢较量。黄巢正是抓住了这一个机会，把下一个进攻的目标定位了唐朝的东都洛阳。
这时朝廷乱作一团，大宦官田令孜自请率两神策军弓弩手去守潼关，更多人则认为黄巢军拥有六十万之众，潼关又无重兵，难以坚守。潼关是首都长安的大门，一旦失守，长安城必然不保。唐僖宗衡量利弊，还是决定让田令孜率兵东守潼关，以保护长安城。
十一月十七日，黄巢大军进抵洛阳城下，唐将齐克让退守潼关，东都留守刘允章则率众出城迎接黄巢入城，洛阳失守。黄巢军进占洛阳不几日，即向关中挺进。当黄巢走到潼关下时，面对潼关上早已吓得发抖的军士，黄巢心中无限的得意。连高骈这样的猛人都怕了我，你们这帮鼠辈还要在这抵挡我的大军吗?这是黄巢一生中说的最有底气，也最有气概的一句话，此时他心中所受的委屈，全部在这一刻得到了巨大的释放。
潼关之上的士兵都是神策军，这本来是一支由长安豪富子弟组成的军队，他们只是为了厚得供给和赏赐才贿赂宦官挂名军籍的，平日高车大马，悠然自得，未尝经历战阵。听说出征，吓得他们抱头相哭，为了逃避战事，他们以金帛雇商贩与贫民代自己去镇守潼关。黄巢军奋力攻关，而黄巢的谋士尚让又从关旁谷中小道迂回到关后，前后夹攻，官军溃退，潼关失守。
长安城此时就在黄巢的眼前，“冲天香阵透长安，满城尽带黄金甲”，黄巢多年的夙愿就要实现了，这怎能让黄巢不激动呢。冷静、一定要冷静，让天下人都知道我黄巢，我的存在是因为我是这个世界上最有能力的人。黄巢朝着苍天一遍一遍重复着自己的心声。
从潼关退下来的乱军一下子拥进了长安城，唐僖宗知道长安再也无险可守，在田令孜神策军的护卫下，狼狈逃往成都避难，唐僖宗是秘密逃走的，是为了迷惑黄巢，让其不必快速进攻。而还在长安的文武百官及诸王、嫔妃全部被皇帝抛弃。
金吾大将军张直方与群臣没有办法，只能接受现实，向黄巢投降。黄巢不费一兵一卒便占领了这座古都。此时的黄巢已经无法在形容他的心情，面对城楼周围来围观的民众，黄巢把多年抢劫来的金钱抛给了他们。去抢吧，黄巢看着穷苦的民众，伏在地上来抢他扔下的财务，心情无比痛快。
黄巢进入长安春明门后，升座太极殿，宫女数千迎拜，黄巢此时已经自称自己为黄王了。而此时，尚让向民众们喊了一句话，“黄王起兵，本为百姓”。这句被无数现代历史书引用的名句，很快就被历史无情的证明，它是中国历史上最虚伪的谎言。
只过了几天，黄巢的军队就露出了本相。他们开始挨家挨户的上门索取财务，美其名曰：“淘物”。后来，事件开始升级，穷人的家里已经榨不出什么来了，所以富人的家里成了重灾区，富人官吏的家中妻子女儿，被黄巢军任意强奸凌辱。
如果是当官的被黄巢的军队逮到，全部杀头，其宅邸也被没收。宰相豆卢瑑、崔沆及左仆射于琮、右仆射刘邺、太子少师裴谂等藏匿民间，被义军搜出后全部被杀，库部郎中郑綦拒不投降举家自杀。投降黄巢的左金吾大将军张直方因匿公卿于夹壁墙中，事发后被杀。
而大唐的宗室皇亲们，毫无意外，被全部灭族。驸马都尉于琮拒不投降说道：“吾唐室大臣，决不能侍奉黄巢你这个奸贼。”黄巢大怒，斩杀了于琮。于琮的夫人广德公主看见丈夫被杀大骂黄巢，并告知黄巢我是天子的女儿，愿意和相公同死。广德公主与丈夫同一天遇害。
一切的一切，都源于黄巢那种报复的心理，在他的心里这些人伤害了他的自尊，为什么你们可以呆在国家的政治中心，荣华富贵，而我却不能。我现在站在了这里，你们每个人都看到了，我不比你们差多少。去哪里搞军粮?
广明元年(公元881年)十二月十三日，黄巢称帝，建立了大齐政权。
黄巢在长安当上了天子，而生活却越发淫荡和奢侈了。这种未得天下就沾沾自喜的做法，就代表了一种流氓无产阶级的本质，因为他们根本就没有把天下和人民作为自己的首要任务，一旦他们达到了目标，获得了一些成绩，他们的心就开始满足。
从这点上来看，黄巢、李自成包括后来的洪秀全之流都和朱元璋这样的彻底的农民起义者相差太远了。因为黄巢的奢靡腐化，长安有人题诗讥讽，黄巢大怒彻查此事，可是怎么查也查不出个结果来，黄巢再也不遵守攻占福州、广州时那个不杀儒生的偈语，索性把长安城中三千多无辜的儒生都砍了头。
就在黄巢正在长安养尊处优的时候，一个重大打击来了，各路藩镇在各地连连痛击黄巢军。黄巢连年的挥霍，让他在各地抢掠的财务，消耗殆尽，当然这还不是最要命的问题。黄巢军队入主长安后，并没有召集百姓，开垦荒地，而是坐吃山空。没有二年，黄巢渐渐发现十万大军在长安城内人吃马喂，粮食早就入不敷出。军粮变成了黄巢此时的最大危机。
可是此时，长安周围，无论百姓还是地主，早就被黄巢的军队搜了个底掉，他们全都没有余粮了。怎么办?黄巢只能采取权宜之计，这项计策的实施，把那句“黄王起兵，本为百姓”的言语击得粉碎。人吃人，黄巢军队开始抓长安附近的百姓，这些人变成了黄巢军队的口中之食。
无辜的百姓被杀充当军粮，虽然黄巢这事做的极为隐秘，但是没有不透风的墙，这件事还是被传得沸沸扬扬，在这场浩劫中百姓们终于认清了黄巢的真面目。公元882年，王处存与当时各路官军大败了尚让的大军，进逼京师，黄巢大慌，丢下了一切，开始逃跑，可是并没有跑远。城中的百姓见这个杀人魔王终于被赶走了，都欢呼雀跃，对官军夹道欢迎。
王处存犯了经验主义的错误，认为黄巢已经跑远了，不可能再回来，所以睡得很安稳，没想到当天夜里，黄巢就组织了反击，把王处存又赶出了长安。长安城再度易主。当黄巢再次坐在皇位上的时候，他的在自尊心无法容忍这些背弃他，而支持官军的百姓。你们为什么看不起我呢?我难道要比李氏差吗?黄巢下令，屠城。
在这次大屠杀中，长安城所有的男性公民基本上全部被杀，长安街道，血流成河。当时尸体基本上把路都堵死了，连个下脚的地方都没有。《新唐书》也记载在这场屠杀中的死亡数字，超过八万人被杀。而这八万人都是手无寸铁的无辜平民。
而就当黄巢屠杀长安城的百姓时，一个坏消息也来了，他派出去攻打邓州的大将朱温投降唐朝了，不是诈降，而是真的投降了。此时，一个黄巢命运中的克星也走到了历史的前台，李克用，沙陀人。这个人基本上可以说是决定了五代十国甚至是后来大宋朝以及契丹等少数民族走向的人，他和他的儿子可以称的上是中国历史上少有的战神。
沙陀军来了多少人呢?不多，只有一万。
而黄巢军驻扎在长安附近的就有十万人，还有几万人游走在长安周围的地区。可是就是这样十比一的比例，竟然是沙陀人大获全胜，李克用不费吹灰之力就杀进了长安城。
黄巢这次体会了一把什么叫人比人气死人，一个强大的人物终于站在了自己的眼前，之前虽然黄巢也有失败，但是他没有灰心过，他依然可以站起来继续战斗下去。而这次不同了，长安的丢失让黄巢彻底心灰意冷，终于他对自己产生了怀疑。
失落感瞬间让黄巢变得歇斯底里起来，在他的眼前再也没有目标和任何的规划，他的一切梦想已经在长安城被李克用击得粉碎了。黄巢的军队瞎驴撞槽一样，又回到了他起兵的河南，当然这里早就不是他的了。很快他将迎来他命运的最后的那个地点，也是他人生的污点被涂抹的最大的那一处地方--------陈州。
陈州就是今天的河南淮阳，黄巢派自己的心腹爱将孟楷对他展开了攻击。陈州刺史赵犨可不白给，他早就在陈州周围设下了埋伏，一举袭击了孟楷所部。孟楷被俘、被杀，其军队大败而回。这个人的死给了黄巢又一次重大的打击，因为这是黄巢最为倚重，也是唯一可以倚重的大将了。孟楷的死，让黄巢彻底愤怒，他纠集了唐朝的降将秦宗权合兵围攻陈州。
陈州这一被围就是百日，此时双方都在苦苦的挣扎，因为无论是陈州城里还是城外，都面临着一个问题，那就是缺粮。没粮食吃怎么办?把能吃的都吃了。能吃的都吃了，还饿怎么办?没办法，吃人。可是人也是有限的。
赵犨没粮食了，就派人出来征粮，百姓早就没有粮食了。官军出来运回十车尸体回去吃。黄巢发现了这个问题，一个彻底疯狂的人是什么都干得出来的，他怕官军将这些“粮食”都抢光了，竟然下达了一个令人作呕的命令。开始黄巢的军队饿的是不行了，全都靠在墙上，毫无力气，见到活人就把他们先杀了，然后吃掉，这样被害的百姓，一天竟然达到了数千人。
后来因为赵犨的官军也来这里抢人，黄巢干脆就打了个提前量，把这些活人都变成便携食品得了，不用这么麻烦了。黄巢下令制造了数百巨碓，同时开工，陈州周围瞬间变为了大型的肉联厂(史称捣磨寨)。大批活生生的乡民、俘虏，无论男女，不分老幼，悉数纳入巨舂，顷刻磨成肉糜。后来因为粮食越来越紧张，肉联厂甚至连先前的那些剔骨抽肠的前期准备都省了，把活人就扔进巨舂中，人的内脏和骨头都搅在一起，做成肉酱以供黄巢军食用。
河南、许、汝、唐、邓、孟、郑、汴、曹、徐、兖等数十州的百姓，除了陈州(赵犨守卫)和汴州(黄巢的叛将朱温守卫)外，基本上被黄巢吃光了。据保守统计，当时被黄巢军吃掉的人数，超过三十万人。
善恶到头终有报，黄巢的命运也在这次骇人听闻的事件之后被划上了休止符。在黄巢围攻陈州时，唐朝不断调动军队，以围剿黄巢军。李克用又来了，已经是唐朝河东节度使的李克用亲率蕃、汉兵五万前来增援。黄巢见官军四面围来，只得从陈州撤军，而天公这时也似乎不再会给这位魔王任何逃生的机会。
五月，天降大雨，而且一下就是几天，平地水深达到了三尺，黄巢的军营让水给灌了。当黄巢军从中牟(今河南中牟)北汴河王满渡口渡河时，李克用击其半渡，黄巢军大败，死伤万余人。最令黄巢郁闷的还不只是这件事情，最郁闷的要数，黄巢最铁杆兄弟尚让，也就是向百姓们大喊“黄王起兵，本为百姓”的那位仁兄，竟然在此时投降了唐朝。
黄巢率残兵败将向东北逃去，李克用又追杀到封丘(今河南封丘)。这时天又下起了大雨，黄巢军行动速度有慢有快，迅速脱节，黄巢只带亲兵近千人，冒雨东奔兖州。而命运不会再给这位魔王任何的机会，六月十五日，武宁将李师悦与尚让追至瑕丘(今山东兖州)，黄巢与唐军打了最后一场仗，结果是他身边最后的那点亲信也彻底报销了。
此时，谁都知道一句话，那就是大势已去，包括和黄巢一起起兵的人。黄巢的外甥林言走至泰山狼虎谷的襄王村(今山东莱芜西南)，突然对黄巢举起了屠刀，黄巢早就精疲力竭，虽然武功高强，却再无反抗之力。
一道寒光，黄巢已经身首异处。中国历史上一个罕见的嗜杀狂，走完了他罪恶的一生。
林言又将黄巢的兄弟和妻子尽数杀死，并提着黄巢等人的人头向唐朝军队乞降。可是不巧，迎面碰到了沙陀人，可能是因为语言不通巴，沙陀人没有理解林言的意思，把这位小丑型的人物也杀了了事，然后多提了一颗人头献给了当时的前线指挥时溥。
一切都结束了，白寿彝先生的《中国通史》是这样记述黄巢这个人物的。我们最后只能记住，黄巢是个知识分子，也是个杀人狂。
