太平天国时期，天王洪秀全“严种族之辩”，命令凡是太平军占领的地方，所有旗人一律格杀勿论。所以在太平天国攻占过的地方，所有旗人全部遭到灭绝！
1853年3月8日，太平军包围南京，仅7日，攻下了南京城。城内自江宁将军祥厚以下的旗人男女老幼大约有4万多人，统统被杀，一个不剩。
1860年5月15日，李秀成自统数万太平军东征苏常地区。仅仅用了一个多月时间，除上海之外，苏南所有地区尽为太平军攻克，所以旗人，全部被屠。
1861年12月29日，李秀成率领太平军，第二次攻克杭州，直下满城，冲进满城的将士将旗兵全部砍光，共杀死旗人驻杭州的1万名旗兵，将军瑞昌自杀......
太平天国失败后，清廷重新调集旗人进驻南方各传统据点驻军。这些驻防的旗人在后来的辛亥革命中，大部分也没逃出被屠杀的噩运！
1911年，以“驱逐鞑虏、恢复中华”为纲领的辛亥革命爆发！旋即湖南、陕西、江西、山西、云南、贵州、浙江、江苏、广西、安徽、四川以及福建、广东等省先后宣布脱离清政府而独立。
辛亥首义的武昌城是排满屠杀最先开始的地方，一位当时在武昌的外国传教士描述了当时的屠杀情形：街上躺着近万具旗人男女的尸体，死的很惨，其中800多具单独放在一扇大门外......
辛亥革命中，屠杀旗人规模最大的要数发生在陕西省西安的排满流血事件。当时清廷驻防在西安的两万多名旗人及其家眷，不分男女老幼全部被屠杀。
在太原，旗人居住的防地城门洞开，蜂拥而至的革命人士把来不及逃跑的旗人全部屠杀殆尽。
在福州、杭州、南京、苏州、江阴、广州、宁波、成都、洛阳还有其他一些城市，都有旗人被大规模屠杀的记载。“当时杭州、河南等地，革命人士把砍下的旗人人头扔进井筒子里，一个一个的井筒子，填得满满的……”（《李提摩太在华回忆录》）。
在湖北，革命军唐牺支所部占领荆州城，将驻防荆州满城2万5千名旗人杀得只剩三四千人。
在广州，旗人迫于革命军武力，主动向革命军投降，并宣布和清政府脱离，后人叫“和平易帜”。他们放下武器、脱掉军装、走出八旗军营。但这部分投降的旗人仍有大部分被屠杀，剩下旗人只能逃离广州城改名换姓，沦为乞丐或娼妓以度日。当时广州近郊的城镇，盛行的“旗人妓女”即源自于此。清光绪年间广州八旗有3万多人，到辛亥革命时期已经只剩1500人了......
