关于侵华日军第七三一部队罪行、细菌战史的学术研究成果，经中国知网搜索，查询到相关论文及报告近300篇，发布时间自1982年至今，分别刊载于期刊、报纸会议论文和研究生论文。目前有关侵华日军第七三一部队和细菌战史问题的学术研究，主要在中日学者间进行，论著成果也以中文和日文为主，而英美学者鲜有参与。二十一世纪初，美国解密了大量日本细菌战档案资料后，为“七三一”问题的学术研究带来了机遇。虽然我国学者和一些爱好和平的日本人士陆续发表了一批回忆、揭露和批判的书籍，公开了一些资料并绘制了七三一旧址核心区平面图，但这些资料在侵华日军第七三一部队的累累罪行中只是一小部分，现有资料在未来的研究与展示中远远不够。另外，七三一旧址保护、利用和考古发掘的专项研究成果较少，因此，考古工作成为重要的实物资料来源，考古成果将有利于揭示其分布规模和历史状况，取得科学数据，丰富馆藏文物，指导保护与展示工程的实施。

七三一部队旧址实地调查始于20世纪80年代，1982年由哈尔滨市地方志办公室牵头对平房区和哈尔滨市内的七三一遗存进行了初步考察。1987年5月，七三一陈列馆邀请安徽省滁县地区文物保护科帮助勘测细菌实验室及特设监狱遗址，发现部分地下遗迹。2000年8月，黑龙江省煤田地质物测队受平房区政府委托对细菌实验室及特设监狱遗址进行了物理勘探，确认了地下部分遗迹，但勘测的数据与实际多有偏差。同年8月，哈尔滨市和平房区政府会同市军分区对细菌实验室及特设监狱遗址进行了部分清理。

2008年9至10月，黑龙江省文物考古研究所与七三一陈列馆联合黑龙江省地球物理勘查技术院，对七三一旧址核心区进行了全方位地球物理勘探。此次所使用的地球物理勘探技术主要为较先进的地质雷达勘探法和高密度电流勘探法，结合部分考古试掘，因此取得了较为显著的效果。作为调查勘探的成果，形成了记录完整的《侵华日军第七三一部队遗址调查与勘测报告》，为下一步的旧址发掘研究工作提供了颇有参考价值的线索和科学依据。