至今日本还保存着不少徐福活动的遗迹，如歌山县徐福和他的船员七人墓，九州岛佐贺县徐福上陆地纪念碑等。

关于徐福东渡安居日本的这一说法，虽然很多人都相信那是真的，毕竟有史料可查，但是这其中还是有一点疑问存在的，那就是徐福带着的那些人是如何安全到达岛上的?

随着科学技术的进步，近来来，日本方面进行了一次利用基因检测技术与世界人种的信息进行比对，通过这次的研究，发现了日本人的基因里有百分之五来自于中国的云南地区，其他的部分基因中还显示了有北美人的影子。

复旦大学教授表示，日本大和族可能是世界上各人种混合最复杂的民族，混合了澳大利亚人种、尼格利陀人种、黄种人、白种人等四个人种。

首先是澳大利亚人种和尼格利陀人种。

距今3万年前，现代人类的一支澳大利亚人种通过当时还高于海平面的东海大陆架，到达了日本岛。澳大利亚人种也称为“棕色人种”，他们头发蓬松卷曲、大鼻子、凹眼睛。

澳大利亚人种迁徙到日本岛后不久，尼格利陀人也到达了日本岛。这一人种又称为“矮黑人”，个头很矮、皮肤黝黑。后来尼格利陀人种取代了澳大利亚人种，70%的男性成分为尼格利陀人，相当于父系传下来。

尼格利陀人种、澳大利亚人种构成的日本人称为“绳文人”。绳文人是最“纯正”的日本人。绳文人最直系的后代是阿伊努人，所以说阿伊努人是日本最早的原住民，但日本历史并不承认他们的身份，相反强调他们是“蛮夷”。日本幕府将军全称就是“征夷大将军”。

现如今，阿伊努人在日本被称之为“阿伊努族”，日本官方统计阿伊努族人口为2.5万人，非官方统计为20万人。但实际上，现在血统纯正的阿伊努人已经非常稀少。他们生活在北海道。