推测二:一两千年以来,亚洲中部的气候正朝着越来越干旱的方向发展。在楼兰繁荣时期,那里的降水量足以供给农作物正常生长。后来气候开始干旱，降水量减少,风沙灾害频繁，农作物颗粒无收，楼兰居民只好离乡背井，向别处搬迁了。不久风沙就淹没了古城，断绝了人烟。

推测三：楼兰消失与丝绸之路北道的开辟有关。经过哈密(伊吾)、吐鲁番的丝绸之路北道开通后，经过楼兰的丝绸之路沙漠古道被废弃，楼兰也随之失去了往日的光辉。

推测四：楼兰被瘟疫疾病毁灭。一场从外地传来的瘟疫，夺去了楼兰城内十之八九居民的生命，侥幸存活的人纷纷逃离楼兰，远避他乡。

推测五：楼兰被生物入侵打败。一种从两河流域传入的蝼蛄昆虫，在楼兰没有天敌，生活在土中，能以楼兰地区的白膏。

推测六，成群结队地进入居民屋中，人们无法消灭它们，只得弃城而去。

说法七：由于中亚游牧民族侵入,导致本土文化被毁灭,当地的居民逃往他方,楼兰随后就走向了衰亡。

有许多学者则相信水源断绝的假说。他们认为，楼兰气候历来干旱，雨水极少，要发展农牧业生产，供应城内居民，必须引水灌溉，因此，水源是楼兰城的命脉。这些学者到这里进行考察以后推断，当年源远流长的塔里木河和孔雀河就在楼兰附近流过,它们汇聚成的大湖一罗布泊也曾在古城的旁边。清清的湖水和浩灌的湖面给楼兰地区带来了无限生机。胡杨林遮天蔽日，芦苇荡鱼虾成群，田野上庄稼葱翠，草地上牛羊肥壮。后来，放荡不羁的河流改了道，罗布泊逐渐缩小、干涸。水源断绝以后，人们再也无法在这儿生活，只能奔走他乡。楼兰从此就消失了。