但是，晚年的汉武帝变得昏庸，在后来江充等人导演的巫蛊之祸中，汉武帝勃然大怒，让江充彻查，而这个江充为的就是要搞掉太子，于是不仅太子刘据，皇后卫子夫等被牵连进来，就连卫长公主也被定罪。因为巫蛊事件最后被杀的人超过3万，卫子夫，太子刘据惨死，而卫长公主被判了腰斩酷刑。
在古代腰斩那绝对是酷刑，将人俑大刀砍为两半，十分凄惨。而且一般行刑的时候，犯人要脱光衣服，这样下刀才不会滑，以免砍在衣服上一刀砍不死，那就更痛苦了。而关于卫长公主被杀的过程，正史并没有记载，反倒是一些野史和宫廷记录描述了这一幕。
据悉当天卫长公主和其他犯人押送刑场，由江充等监斩，当时卫长公主在宫女的搀扶下走到腰斩的刀下，侧着身体躺下，然后宫女将其衣服脱掉。而行刑的刽子手看到美丽动人的公主，都不忍下手，于是江充只得换了3个刽子手，才一刀将公主砍成两半，一代最美公主，香消玉殒。事后汉武帝明白过来，将江充等全部灭族。
