在吉林崖山腰与后金骑兵、夫役相持的杜松军，先是遭到渡过浑河上山杀来的代善和皇太极的夹攻，现在不仅接到大营的败报，而且又见努尔哈赤率六旗大军统统杀来，不禁锐气大挫，结果被打得落花流水。杜松和王宣、赵梦麟等将官，全部阵亡；部卒更是尸横山野，血流成渠，剩下不多的余众，狂奔了20里，到舒钦山天色已黑，方才止住。

解决了明军左翼中路的第二天，即3月2日，努尔哈赤立即向开原马林一路发起攻击。马林闻杜松败，便布守于尚间崖，环营掘壕，壕外前列火器、后布骑兵，分派潘宗颜一军守斐芬山，派龚念遂一军守斡浑鄂谟，各距数里，皆列大车拒骑突。

努尔哈赤先集中全力破龚念遂军，又前后夹击攻破尚间崖，拒者尽死，叶赫兵尽逃，马林仅以身免。

尚间崖破后，后金军下马仰攻斐芬山，潘军尽覆。明朝的左翼北路大军，也在一天之内被全歼了。

南路明军，由刘綎领着，出宽甸口、进栋鄂路，一路稳扎稳打，打到离赫图阿拉只有五十里的腹地，只候朝鲜援兵会合齐进了。

努尔哈赤一面急调兵回守，一面巧派后金兵持杜松令箭，乔装入刘营，说杜松已胜，杜军已逼赫城，催刘速进。路窄，刘乃分兵为四，自率前军进入阿布达里岗，皇太极居高击下，代善兵假冒杜松军旗帜衣甲诈入刘营夹攻。刘綎力战而死，余军随被瓦解。

杨镐闻三路皆败，急令右翼中路李如柏军归。

这样，五六日之内，明军三路惨败，文武将吏死了300多人，军士被歼45000余人。萨尔浒一战，极大地削弱了明朝边兵的实力，充分地暴露了明朝“上下隔阂、皂白多混，所养非所用，所用非所养”的致命弱点，奠定了后金渐强渐胜的基础，堪称是满清(后金)的立国之战。