根据现存国民政府教育部档案等史料，朱家骅似乎并不似前面王世杰所批评的那样消极。1946年12月31日，教育部即向各地教育主管部门、各大专院校发出电令，要求各地加强防范，即各地教育厅局、各大学在复电中提到的所谓“亥世电”。如致北大校长胡适、清华校长梅贻琦、北平师院袁院长、北平铁道管理学院徐院长的电报，称沈案“系违警刑事案件，自应听由法律解决。现闻有人假此鼓动风潮，未免太无意识，贻笑中外，应速设法劝阻，并整饬风纪为要。”1月4日，根据蒋介石和行政院的指令，教育部向各地发出了“子支电”。如致胡适、梅贻琦的电报，通报了上海、南京的学运，“查系有人鼓动反政府及反美运动。”提请该两校首脑“注意防范，并希设法抗议，有所表示，以正观听，并劝导学生严守秩序，安心学业。”一方面也在力争对罪犯的惩处，31日晚上，朱家骅见司徒雷登，“告以沈崇系出名门，地点情景天时决不类和奸，”提请他对“中国人方面证据必须尽量注意”。1947年1月1日，朱家骅又致电胡适，询问：“女生案实情如何，据闻该女生原与美军相识，究竟如何，”要求尽速查明报教育部。几天后再电胡适，告以“此间对沈女士颇有不利之传说，我皆不信，……沈万不可离平，否则只有一面证据，不可收拾，受害人证据与法律观点必须彻底弄清，并不可延长时日”。

对教育部的“亥世”、“子支”两电，各地均有回复，以重庆大学校长的复电为例，该电称：“教育部钧鉴，两奉密电，嘱劝阻学生游行，严防煽动、逾轨各节，当经译转渝区各校遵办”。1月14日，教育部又主动要求中统局向其提供有关学潮的情报：“密，中央调查统计局：据报此次京沪一部分学生为北平美兵事件游行系由中共策动，希设法蒐获此项证据，惠予送部以便办理为荷，教育部。”

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