事后，率部败走野人山的杜聿明惨痛地说：“各部队因落伍、染病死亡的，比在战场上与敌战斗而死伤的还多数倍!”在这场大溃退中，第五军4.2万余人，回国后仅剩不足2万人，除战死者，1.47万余人被夺去了生命。
1942年8月，杜聿明奉蒋介石令回国，杜聿明以昆明防守司令部总司令兼第五军军长，该军亦调回国整训。隶属该军的新二十二师在撤到印度后，编入中国驻印军序列。回国的第五军下辖第九十六师，师长余韶、第二百师师长高吉人，另将第六十六军之新编第三十九师改隶该军。
1943年1月28日杜聿明改任第五集团军总司令，总司令部由昆明防守司令部改编而成。第五军军长由新一军军长邱清泉改任。杜聿明仍兼昆明防守总司令部总司令。一直到抗日战争结束，杜聿明都在昆明。
