荷兰人最早的奴化教育，就是宗教思想的传播，这一点，从他们登陆台湾的早期就开始了，早在明朝崇祯三年（1630年），荷兰传教士康迪钮斯就曾致信东印度公司总部，要求东印度公司用立法的形式，规定台湾当地高山族部落必须信奉基督教。但是荷兰人担心此举会招来各族的反抗，因此暂未成行，此后多年，荷兰人大肆征服高山族部落的过程中，每次战役，都有随军的传教士参加，这些传教士通常都是“一专多能”的，打仗之前，主要做特务，混入各族部落中刺探情报，打仗的时候，主要做医生，给受伤的荷兰兵治病，打完仗以后，又摇身一变成了传教士，兼职做老师，主要工作就是诱导高山族部落信教，并且在当地讲课。从明朝崇祯十五年（1642年）荷兰人赶走西班牙人后，荷兰人开始用立法的形式，强迫当地高山族同胞信教，比如他们规定，每个部落定期都要有传教士去上课，不来听课的，就要受到一张鹿皮的罚款，但是以当时高山族同胞的生活条件，一张鹿皮可以算是天文数字了，根本不力缴纳，所以表面上自愿的信教，也就变成必须信教了。

为了能让基督教起到奴化作用，荷兰人甚至很“大逆不道”，擅自曲解修改基督教教义，基督教里关于和平平等的东东，这些传教士们能不讲就不讲，反而加上了许多“惩罚异教徒”之类的莫须有内容，以收忽悠之效，比如每当荷兰人要征讨其他高山族部落的时候，传教士们总打着上帝的名义，在其他部落广招教友，用其他部落的力量，来替荷兰人打高山族同胞，制造的结果，就是高山族各部仇杀内斗不断，荷兰人不费吹灰之力，即巩固了他们的统治。

随着荷兰人控制区域的扩大，人口的不断增多，先前简单的派传教士传教，显然是不够用了，荷兰人又开始规模化经营，主要的方式，就是办学校。